Интересно почему Джин жива и здорова .
Мой вариант: Магнето остался без шлема и теперь как ноль без палочки. Пакостит где-то по-мелкому, но против профессора не выступает. А значит событий первого, второго и третьего фильма не было. Возможно у Джин был припадок, но произошёл в стенах университета и профессор ей крышу поправил.
Возможно он просто не лез ей в голову изначальна, а научил пользоваться и управлять способностями.